GUIDE-seq体内脱靶检测
我们开发了一种高通量的、高敏感性和特异性的、同时检测切割效率和脱靶效应的有效sgRNA筛选方法——GUIDE-Pro。是基因编辑研究中不可或缺的脱靶检测方法,也是广大科研人员进行sgRNA筛选的利器。
扩增子测序
扩增子测序通过对靶基因区域附近设计引物,进行PCR扩增,并对PCR产物进行高通量测序,可以快速高效的获得目标区域的突变频率信息,尤其是对低频突变的检测效果远远优于一代测序,性价比极高。
SITE-seq体外脱靶检测
SITE-seq原理如下:提取高分子量DNA,直接进行体外切割,加带有生物素标记的接头,DNA片段化,加上另外一端接头,PCR扩增完成文库构建。最后采用PE150策略进行测序。
高通量R-loop脱靶检测
高通量R-loop脱靶检测,是单碱基编辑中不可或缺的脱靶检测方法,也是广大科研人员进行CBE编辑器筛选的利器。相比于传统的全基因组测序,R-loop高通量脱靶检测省时省力,经济实惠,可用于规模化的评估
GUIDE-seq体内脱靶检测
我们开发了一种高通量的、高敏感性和特异性的、同时检测切割效率和脱靶效应的有效sgRNA筛选方法——GUIDE-Pro。是基因编辑研究中不可或缺的脱靶检测方法,也是广大科研人员进行sgRNA筛选的利器。
实时定量PCR
实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。
甲基化分析
我们利用重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而在适当的实验条件下甲基化的胞嘧啶保持不变,再进行PCR扩增,甲基化的位点可以被当作一个C/T的SNP来处理;可利用直接测序法来判断是否CpG位点发生甲基化。