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链特异性转录组测序（strand-specific RNA sequencing）是指在构建测序文库时，利用Illumina高保真Taq酶将mRNA链的方向信息保存到测序文库中。

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全外显子组测序WES（Whole Exome Sequencing）是指利用序列捕获或者靶向技术将全基因组外显子区域 DNA 富集后再进行高通量测序的基因组分析方法。

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环境样品的宏基因组鉴定  微生物基因组测序  病原体检测  人类目标序列重测序  扩增子直接克隆测序（PCR产物）  传染病源快速鉴定  转录组研究  肿瘤基因组和突变

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转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA。转录组测序能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息。

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全基因组重测序(Resequencing)分析是对已知参考基因组序列的物种进行不同个体间的基因组测序，并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。

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16S rDNA序列（在所用物种中高度保守）是最常用的细菌分类标准，通过提取环境样品的DNA，并扩增其中16S rDNA基因；通过检测16S rDNA 的序列变异和丰度，反映环境样本中细菌的分类和丰度

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circRNA 是通过特殊的选择性剪切产生封闭环状结构的非编码 RNA。 circRNA 不受 RNA 外切酶的影响，比线性 RNA 表达更稳定。研究表明，某些特殊的 cirrcRNA 分子富含miR

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mRNA测序在检测基因表达的同时，还能够获取mRNA结构信息、识别可变剪切位点和cSNP突变、解析RNA编辑，从而获得更全面的mRNA信息。

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Illumina公司的Solexa测序技术是一次运行就能产生数百亿到数千亿高质量碱基的革命性化学方法，这种技术的成本不足毛细管测序千分之一。Solexa测序技术运用了微阵列技术和专有的可逆终止子技术，

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