研究背景
已有研究表明,microRNAs(miRNAs)在膀胱癌的肿瘤发生和恶化中发挥重要作用。然而,个体和小样本研究易造成结果的差异性,基于miRNA微阵列数据分析的膀胱癌组织miRNA表达谱的全面调查还未见报道。
研究目的
广西医科大学林星谷和陈迎春领衔的课题组运用miRNA微阵列芯片技术,对膀胱癌瘤组织和配对的正常组织进行了miRNA表达谱的差异分析。
研究结果
课题组通过miRNA微阵列技术,对来自于519个膀胱癌组织样本的miRNAs进行了差异表达分析筛查。在21个已发表的微阵列数据集中选出11个候选miRNAs,使用vote-counting strategy 和 Robust Rank Aggregation算法进行分析。其中5个下调(miR-133a-3p,miR-1-3p,miR-99a-5-p,miR-490-5p和miR-133b)和6个上调(miR-182-5p,miR-935,miR-518e-3p,miR-573,miR-100-3p,和miR-3171)miRNAs。随后,对miRNAs进行了靶基因预测和潜在通路富集分析,揭示其在膀胱癌的肿瘤发生中的分子机制。异常表达miRNAs的研究发现,其大部分相对路径与不同的生物过程,细胞成分,分子功能,癌症发病机制,一些细胞信号(如Wnt信号,胰岛素/ IGF, PI3激酶,FGF信号通路)密切相关。
图 细胞成分GO富集分析
研究意义
本项研究首次获得一个膀胱癌组织miRNA表达模式的全面概述。这些miRNAs可能参与膀胱癌的肿瘤发生和恶化过程。
用户文章
Wei Yanping,et al.(2016)Comprehensive investigation of aberrant microRNA profiling in bladder cancer tissues.Tumor Biol.DOI 10.1007/s13277-016-5121-z.
本研究中的miRNA芯片分析由联川生物协助完成
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